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迪飛學(xué)術(shù) | mNGS揭示肺部菌群在肺移植受者原發(fā)性移植物功能障礙中的作用

瀏覽數(shù)量: 0     作者: 迪飛醫(yī)學(xué)     發(fā)布時(shí)間: 2024-05-10      來(lái)源: 迪飛醫(yī)學(xué)

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導(dǎo)    讀

近日,中日友好醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科與迪飛醫(yī)學(xué)合作,對(duì)32例肺移植合并原發(fā)性移植物功能障礙(Primary graft dysfunction, PGD)患者支氣管肺泡灌洗液行mNGS檢測(cè),探究肺部菌群在肺移植合并PGD患者中的作用。研究表明PGD 3級(jí)患者的肺部菌群存在變化,肺部菌群的失調(diào)與肺部免疫有關(guān)。該研究成果已發(fā)表在The Journal of Clinical and Transplantation Research。

 

研究背景

肺移植(Lung transplantation, LT)是終末期肺疾病患者的最終治療選擇,原發(fā)性移植物功能障礙(PGD)是肺移植后常見(jiàn)并發(fā)癥。

 

PGD是一種肺移植后72小時(shí)內(nèi)發(fā)生的急性肺損傷的臨床綜合征,表現(xiàn)為低氧血癥和胸片上的肺泡浸潤(rùn)。高級(jí)別的PGD與肺移植后預(yù)后較差相關(guān)。

 

肺部微生物在肺部發(fā)育、免疫以及促進(jìn)或抑制肺部疾病的發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。本研究利用mNGS技術(shù)探究PGD與患者肺部菌群的關(guān)聯(lián),并評(píng)估微生物群特征對(duì)患者早期預(yù)后的貢獻(xiàn)。

 

研究結(jié)果

重度PGD改變肺部微生物組成

11名PGD 3級(jí)(PGD 3組)和21名PGD 0-2級(jí)(對(duì)照組)的患者被納入研究。門(mén)水平上放線菌門(mén)、變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和軟壁菌門(mén)豐度最高,而在種水平,紋帶棒狀桿菌、粘滑羅氏菌、鮑曼不動(dòng)桿菌、銅綠假單胞菌、金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌等是最常見(jiàn)的物種(圖1A,B)。

 

兩組患者肺部的某些菌群在目、科和屬水平上豐度不同(圖1C-E)。

 

以上分析表明,PGD的嚴(yán)重程度會(huì)影響肺部微生物群的整體組成。


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圖1 PGD患者的肺部微生物群發(fā)生改變

 

PGD 3級(jí)患者中特定細(xì)菌類(lèi)群豐度存在差異

使用LEfSe比較了PGD 3級(jí)患者和對(duì)照組重要類(lèi)群的相對(duì)豐度,共檢測(cè)到16組細(xì)菌的豐度存在顯著差異(圖2A)。

 

在屬水平上,Modestobacter、Scardovia和新月形單胞菌屬在PGD 3級(jí)患者中富集,而克雷伯菌屬和口小桿菌屬在對(duì)照組中富集。

 

在種水平上,Modestobacter marinus和Scardovia  wiggsiae在PGD 3級(jí)患者中富集,而竇道桿菌和嬰兒鏈球菌在對(duì)照患者中富集。進(jìn)化分支圖顯示,Geodermatophilales目和Selenomonadales目,Geodermatophilaceae科和Selenomonadaceae科在PGD 3級(jí)患者中富集,而在對(duì)照組中Enterobacterales目,Enterobacteriaceae科和Lachnospiraceae科富集(圖2B)

 

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 圖2 PGD 3和對(duì)照組間豐度存在顯著差異的物種

 

PGD 3級(jí)患者的α多樣性與肺免疫功能改變有關(guān)

為了探索肺部微生物群與肺部免疫之間的關(guān)系,我們檢測(cè)了所有患者支氣管肺泡灌洗液中包括IL-6、IFN-γ、TNF-α、IL-2、IL-1β、IL-13、IL-4、IL-8、IL-10和IL-12(p70)在內(nèi)的10種常見(jiàn)人類(lèi)細(xì)胞因子。使用Spearman相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)IL-2與PGD 3組中細(xì)菌α多樣性(Shannon和Simpson)呈負(fù)相關(guān)(圖3A,B)。

 

肺移植患者術(shù)后早期的優(yōu)勢(shì)菌群(總體隊(duì)列)與不同水平的肺泡細(xì)胞因子有關(guān)。鮑曼不動(dòng)桿菌與IFN-γ、IL-2、IL-13和IL-12顯著正相關(guān),金黃色葡萄球菌與IFN-γ和IL-2正相關(guān),嗜麥芽窄食單胞菌與IL-10負(fù)相關(guān),銅綠假單胞菌與IL-1β負(fù)相關(guān),齲齒放線菌與IL-2負(fù)相關(guān)(圖3C)。

 

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 圖3 PGD 3級(jí)患者肺部菌群α多樣性與肺部炎癥增加相關(guān)

 

肺微生物群的多樣性預(yù)測(cè)肺移植受者的早期生存情況

在整個(gè)隊(duì)列(n = 32)中,根據(jù)個(gè)體香農(nóng)多樣性指數(shù)百分位數(shù)將受試者分為三組。8例(25%)患者具有低多樣性(指數(shù)<0.83),16例(50%)患者具有中等多樣性(0.83<指數(shù)<2.37),8例(25%)患者具有高微生物多樣性(指數(shù)>2.37)。

 

再使用 Kaplan-Meier 估計(jì)方法分析每組患者的 30 天總生存率。高多樣性組和中多樣性組的存活率為100%,低多樣性組的存活率為75%(p = 0.041)。在PGD 3組中,幸存者和非幸存者之間的細(xì)菌多樣性無(wú)顯著差異,但非幸存者的α多樣性顯著低于幸存者(0.37 ± 0.46 vs 1.53 ± 1.06,p > 0.05)。


 

結(jié)    論

本研究發(fā)現(xiàn)肺部菌群改變、肺泡炎癥與PGD之間存在關(guān)聯(lián),且肺部菌群的多樣性或許能預(yù)測(cè)肺移植受者的早期生存率。

 

肺部菌群在PGD 3級(jí)患者的診斷和治療中具有潛力,同時(shí)本結(jié)果支持在更大的隊(duì)列中評(píng)估肺部微生物群及其免疫相互作用的預(yù)后和診斷潛力的研究。

 



參考文獻(xiàn):

Wu Y, Huang L, Li M, Cui X, Zhan Q, Wang C. The role of lun-g microbiota in primary graft dysfunction in lung transplant recipients. Clin Transplant. 2023 Dec;37(12):e15152. doi: 10.1111/ctr.15152. Epub 2023 Oct 3. PMID: 37788167.



編譯:Lily   審核:佳、青木   排版:琳



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